РАЗРАБОТКА НАБОРА СИНТЕТИЧЕСКИХ ОЛИГОНУКЛЕТИДОВ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ПАТОГЕНА MORAXELLA OVIS В ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ
DOI:
https://doi.org/10.52578/2305-9397-2023-1-1-50-59Ключевые слова:
моракселлез, полимеразная цепная реакция, праймер, олигонуклеотид, MoraxellaАннотация
В статье приведены данные о разработке синтетических олигонуклеотидов для выявления одного из возбудителей моракселлеза крупного рогатого скота Moraxella ovis. Дезоксирибонуклеиновая кислота референтного штамма Moraxella ovis ATCC-33078 был выделен набором реагентов «РИБО-сорб» и PureLink Genomic DNA Mini Kit. Аналитическая чувствительность с использованием набора олигонуклеотидов в составила 10-5, что соответствует 21 копий или 50 фг в реакции. Аналитическая чувствительность синтетических праймеров проверялась десятикратным разведением дезоксирибонуклеиновой кислоты Moraxella ovis. Специфичность набора олигонуклеотидов Moraxellа доказана тестированием близкородственных микроорганизмов, т.е. референтными штаммами Moraxella bovis 17948ТМ және Moraxella bovoculi 1259ТМ и возбудителей некоторых зоонозов. Использование набора олигонуклеотидов в полимеразноцепной реакции в режиме реального времени показало 100% специфичность для определения культур Moraxell. Набор олигонуклеотидов Moraxella ovis позволяет разработать экспресс-тест-систему с использованием полимеразной цепной реакции в режиме реального времени для диагностики возбудителя кератоконъюнктивита. В дальнейшем полученный научный результат позволит разработать мультиплексную полимеразную цепную реакцию в режиме реального времени, позволяющую одновременно выявлять возбудителей Moraxella bovis, Moraxella bovoculi и Moraxella ovis.
Библиографические ссылки
Моракселлез у КРС в Казахстане [Текст] / Н.П. Иванов [и др.] // Известия НАН РК. Серия аграрных наук. – 2016. - №5 (35). -С.20-29.
Диагностика инфекционного кератоконъюнктивита крупного рогатого скота [Текст] / Р.С. Саттарова [и др.] // Материалы международной научно-практической конференции, посвященной 90-летию со дня рождения В.А.Киршина. – г.Казань, 2018. - С. 261–264.
Episootological monitoring of cattle moraxellosis [Теxt] / N. P. Ivanov [and etc.] // Известия национальной академии республики Казахстан. Серия аграрных наук. - 2019. - №2(50). - С. 112–115.
Moraxellosis in catches of different breeds of meat direction of productivity [Теxt] / N. P. Ivanov [and etc.]. // Известия национальной академии республики Казахстан. Серия аграрных наук. - 2019. - № 2(50). - С.78–82.
Распространение и антибиотикочувствительность изолятов Moraxella bovis, выделенных от крупного рогатого скота в республике Казахстан [Текст] / Н.П. Иванов [и др.] // Ветеринария. - 2020. - №3. -С. 15–20.
The epizootic situation of cattle moraxellosis in several economic entities of the Republic of Kazakhstan [Теxt] / N. P. Ivanov [and etc.] // Veterinary World. - 14(5). – Р. 1380-1388.
Методические указания по диагностике, лечению и специфической профилактике инфекционного кератоконъюнктивита крупного рогатого скота, вызванного бактериями Moraxella bovis и Moraxella bovoculi [Текст]: учеб. для вет.лаб. и вузов / Г.Н. Спиридонов [и др.]. - М.: ФГБНУ «Росинформагротех», 2017. – 36 с.
Саттарова, Р.С. Диагностическая ценность серологических реакции РСК и РДСК при моракселлеза крупного рогатого скота в Республике Казахстан [Текст] / Р.С. Саттарова. // Ветеринарный врач. - 2020. - №4. - С. 9–12.
Саттарова, Р.С. Лизоцимная активность куриного яичного белка при действии на биопленку, образуемую бактериями рода Moraxella [Текст] / Р.С. Саттарова. // Ветеринария. - 2020. - №12. - С. 41–49.
Diagnostic value of CFT/LCFT for cattle moraxellosis [Теxt] / N. P. Ivanov [and etc.] // Вестник НАН РК. Серия аграрных наук. - 2019. - № 2(378). - С.112-114.
Иванов, Н.П. Диссоцированные формы моракселл, выделенные из пораженных глаз КРС [Текст] / Н.П. Иванов, Р.С. Саттарова. // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. – 2021. - №3. - С.104-113.
Джаримбетова О.С. Основные проблемы в животноводстве Казахстана [Текст] / О.С. Джаримбетова.// Вестник КазЭУ. – 2013. - №3 (93) – С. 80-90.
Angelos, J.A. Moraxella bovoculi and infectious bovine keratoconjunctivitis: cause or coincidence? [Теxt] / J.A. Angelos. // Vet. Clin. North Am. Food Anim. Pract. - 2010. - Vol. 26. – P. 73–78.
Infectious keratoconjunctivitis and occurrence of Mycoplasma conjunctivae and Chlamydiaceae in small domestic ruminants from Central Karakoram, Pakistan [Теxt] / Х. Fernandez-Aguilar [and etc.] // Vet. Record. - 2017. – Vol. 181. - P. 232-237.
Descriptive epidemiology of Moraxella bovis, Moraxella bovoculi and Moraxella ovis in beef calves with naturally occurring infectious bovine keratoconjunctivitis (Pinkeye) [Теxt] / A.M. O'Connor [and etc.] // Vet. Microbiol. – 2012. – Vol. 155. - 374–380.
NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools [Теxt] / C.L. Schoch. [and etc.] // Database (Oxford). – 2020. – P. 231-245.
Alexander, D. Infectious bovine keratoconjunctivitis: A review of cases inclinical practice // Veterinary Clinics of North America: Food Animal Practice. [Теxt] / D. Alexander - 2010. - Vol. 26. - P. 487-503.
John, P. Whitcher Corneal blindness: a global perspective [Теxt] / P. John // Bulletin of the World Health Organization. - 2001. - 79 (3). - P. 214-221.
Субботин В.В. Биологические свойства выделенных культур Moraxella bovis [Текст] / B.B. Субботин. // Ветеринарная патология. - 2014. - № 2 (48). - С. 31-34.
Sensitive PCR method for the detection and real-time quantification of human cells in xenotransplantation systems [Теxt] / M. Berker [and etc.] // British Journal of Cancer. - 2002. - Vol.87. - P.1328-1335.
A multiplex real-time PCR assay for the detection and differentiation of five bovine pinkeye pathogens [Теxt] / Zh. Wanglong [and etc.] // Journal of Microbiological Methods. - 2019. - Vol.160. - P. 87-92.
Effects of Moraxella (Branhamella) ovis culture filtrates on bovine erythrocytes, peripheral mononuclear cells, and corneal epithelial cells [Теxt] / H.E. Cerny [and etc.] // J Clin Microbiol. – 2006. - 44(3) – P. 772-776.
Инструкция по применению комплекта реагентов для выделения РНК/ДНК из клинического материала «РИБО-сорб» [Текст]: утверждено приказом Росздравнадзором от 20.09.2009г. №1337-Пр.09 // ФГНУ «ЦНИИЭ» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. – 2009. – с. 1-7. (https://www.amplisens.ru/upload/iblock/259/RIBO-sorb)
Angelos, J..A. Moraxella bovoculi sp. nov., isolated from calves with infectious bovine keratoconjunctivitis [Теxt] / J..A. Angelos.// Int J Syst Evol Microbiol. – 2007. – Vol. 57. – Р. 789-795.
Henson, J.B. Infectious bovine keratoconjunctivitis [Теxt] / J.B. Henson, L.C. Grumbles // I. Etiology. Am J Vet Res. – 1960. – Vol. 21. - P. 761-766
REFERENCES
Moraksellez u KRS v Kazahstane [Tekst] / N.P. Ivanov [i dr.] // Izvestija NAN RK. Serija agrarnyh nauk. – 2016. - №5 (35). -S.20-29.
Diagnostika infekcionnogo keratokon#junktivita krupnogo rogatogo skota [Tekst] / Sattarova ,R.S. [i dr.] // Materialy mezhdunarodnoj nauchno-prakticheskoj konferencii, posvjashhennoj 90-letiju so dnja rozhdenija Kirshina,V.A.. – g.Kazan', 2018. - S. 261–264.
Episootological monitoring of cattle moraxellosis [Text] /Ivanov, N. P. [and etc.] // Izvestija nacional'noj akademii respubliki Kazahstan. Serija agrarnyh nauk. - 2019. - №2(50). - S. 112–115.
Moraxellosis in catches of different breeds of meat direction of productivity [Text] / Ivanov,N. P. [and etc.]. // Izvestija nacional'noj akademii respubliki Kazahstan. Serija agrarnyh nauk. - 2019. - № 2(50). - S.78–82.
Rasprostranenie i antibiotikochuvstvitel'nost' izoljatov Moraxella bovis, vydelennyh ot krupnogo rogatogo skota v respublike Kazahstan [Tekst] / Ivanov,N.P. [i dr.] // Veterinarija. - 2020. - №3. -S. 15–20.
The epizootic situation of cattle moraxellosis in several economic entities of the Re-public of Kazakhstan [Text] / Ivanov,N. P. [and etc.] // Veterinary World. - 14(5). – R. 1380-1388.
Metodicheskie ukazanija po diagnostike, lecheniju i specificheskoj profi-laktike infekcionnogo keratokon#junktivita krupnogo rogatogo skota, vyzvannogo bakterijami Moraxella bovis i Moraxella bovoculi [Tekst]: ucheb. dlja vet.lab. i vuzov / Spiridonov,G.N. [i dr.]. - M.: FGBNU «Rosinformagroteh», 2017. – 36 s.
Sattarova, R.S. Diagnosticheskaja cennost' serologicheskih reakcii RSK i RDSK pri morakselleza krupnogo rogatogo skota v Respublike Kazahstan [Tekst] / Sattarova,R.S.. // Veterinarnyj vrach. - 2020. - №4. - S. 9–12.
Sattarova, R.S. Lizocimnaja aktivnost' kurinogo jaichnogo belka pri dejstvii na bioplenku, obrazuemuju bakterijami roda Moraxella [Tekst] / Sattaro-va,R.S.. // Veterinarija. - 2020. - №12. - S. 41–49.
Diagnostic value of CFT/LCFT for cattle moraxellosis [Text] / Ivanov,N. P. [and etc.] // Vestnik NAN RK. Serija agrarnyh nauk. - 2019. - № 2(378). - S.112-114.
Ivanov, N.P. Dissocirovannye formy moraksell, vydelennye iz porazhennyh glaz KRS [Tekst] / Ivanov,N.P., Sattarova,R.S.. // Sibirskij vestnik sel'skohozjajstvennoj nauki. – 2021. - №3. - S.104-113.
Dzharimbetova, O.S. Osnovnye problemy v zhivotnovodstve Kazahstana [Tekst] / Dzharimbetova,O.S..// Vestnik KazJeU. – 2013. - №3 (93) – S. 80-90.
Angelos, J.A. Moraxella bovoculi and infectious bovine keratoconjunctivitis: cause or coincidence? [Text] / Angelos,J.A.. // Vet. Clin. North Am. Food Anim. Pract. - 2010. - Vol. 26. – P. 73–78.
Infectious keratoconjunctivitis and occurrence of Mycoplasma conjunctivae and Chlamydiaceae in small domestic ruminants from Central Karakoram, Pakistan [Text] / H. Fernandez-Aguilar [and etc.] // Vet. Record. - 2017. – Vol. 181. - P. 232-237.
Descriptive epidemiology of Moraxella bovis, Moraxella bovoculi and Moraxella ovis in beef calves with naturally occurring infectious bovine keratoconjunctivitis (Pinkeye) [Text] / O'Connor,A.M. [and etc.] // Vet. Microbiol. – 2012. – Vol. 155. - 374–380.
NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools [Text] / C.L. Schoch. [and etc.] // Database (Oxford). – 2020. – P. 231-245.
Alexander, D. Infectious bovine keratoconjunctivitis: A review of cases inclinical practice // Veterinary Clinics of North America: Food Animal Practice. [Text] / D. Alexander - 2010. - Vol. 26. - P. 487-503.
John, P. Whitcher Corneal blindness: a global perspective [Text] / John,P. // Bulletin of the World Health Organization. - 2001. - 79 (3). - P. 214-221.
Subbotin, V.V. Biologicheskie svojstva vydelennyh kul'tur Moraxella bovis [Tekst] / Subbotin,B.B.. // Veterinarnaja patologija. - 2014. - № 2 (48). - S. 31-34.
Sensitive PCR method for the detection and real-time quantification of human cells in xenotransplantation systems [Text] / M. Berker [and etc.] // British Journal of Cancer. - 2002. - Vol.87. - P.1328-1335.
A multiplex real-time PCR assay for the detection and differentiation of five bovine pinkeye pathogens [Text] / Zh. Wanglong [and etc.] // Journal of Microbiological Methods. - 2019. - Vol.160. - P. 87-92.
Effects of Moraxella (Branhamella) ovis culture filtrates on bovine erythrocytes, peripheral mononuclear cells, and corneal epithelial cells [Text] / Cerny,H.E. [and etc.] // Clin Microbiol,J. – 2006. - 44(3) – P. 772-776.
Instrukcija po primeneniju komplekta reagentov dlja vydelenija RNK/DNK iz klinicheskogo materiala «RIBO-sorb» [Tekst]: utverzhdeno prikazom Roszdravnadzorom ot 20.09.2009g. №1337-Pr.09 // FGNU «CNIIJe» Federal'noj sluzhby po nadzoru v sfere zashhity prav potrebitelej i blagopoluchija cheloveka. – 2009. – s. 1-7. (https://www.amplisens.ru/upload/iblock/259/RIBO-sorb)
Angelos, J..A. Moraxella bovoculi sp. nov., isolated from calves with infectious bovine keratoconjunctivitis [Text] / Angelos,J..A..// Int J Syst Evol Microbiol. – 2007. – Vol. 57. – R. 789-795.
Henson, J.B. Infectious bovine keratoconjunctivitis [Text] / Henson, J.B., Grumbles,L.C. // Etiology,I.. Am J Vet Res. – 1960. – Vol. 21. - P. 761-766.
Загрузки
Опубликован
Версии
- 2023-03-28 (5)
- 2023-03-28 (4)
- 2023-03-28 (3)
- 2023-03-25 (2)
- 2023-03-25 (1)