The DEVELOPMENT OF PRIMERS FOR UNIVERSAL DETECTION OF THE NS1 GENE FROM VARIOUS SEROTYPES OF THE BLUTANG VIRUS
DOI:
https://doi.org/10.52578/2305-9397-2024-3-1-264-272Аннотация
В статье приводится краткое описание ситуации по болезням Блутанга. Рассмотрены результаты разработки праймеров для индикации и идентификации возбудителя блутанга на основе полимеразной цепной реакции.
В этом исследовании были проанализированы сохранившиеся гены vp7 и NS1 BTV. В качестве найденного фрагмента была взята сохранившаяся область гена NS1 над 5'-концом, и на основе этой области были созданы уникальные праймеры. Результаты показали, что новые праймеры могут быть использованы в ПЦР для успешной и уникальной идентификации 14 различных случайно выбранных серотипов BTV. Специальная чувствительность ПЦР в предварительном тесте составила 105 копий/мкл BTV 4, и этот показатель следует улучшить путем оптимизации условий реакции. Повторение метода с новыми грунтовками прошло успешно. Результаты также показали, что имитационные паттерны могут быть успешно найдены. Более того, на завершение анализа ушло около 3 часов. В этом исследовании каждый эксперимент проводился в трех экземплярах с одинаковыми результатами.
Используя набор индивидуальных праймеров для ПЦР, он подходит для выявления гена NS1 различных серотипов BTV и может быть полезным инструментом для мониторинга BTV.
Библиографические ссылки
Syurin V.N. Viral diseases of animals [Text] Book / V.N. Syurin et al. - M.: VNITIBP.- 1998.-928 p.
Mertens P.Pi. et al. Analysis of the roles of bluetongue virus outer capsid proteins VP2 and VP5 in determination of virus serotype [Text] / P.Pi Mertens et al. // Virology.- 1989. - 170:-P. 561-565.
Gutsche, T. There was a man [Text] /T. Gutsche// Timmins.- Cape Town. - 1979. - P.4.
Hutcheon D. Malarial catarrhal fever of sheep [Text] / D. Hutcheon//Vet. Rec. - 1902.-14.-P. 629-633.
Spreull, J. Malarial catarrhal fever (bluetongue) of sheep inSouth Africa [Text] /J. Spreull //J. Comp. Pathol. Ther. - 1905. - 18. - P.321-337.
Savini G. et al. The isolation of bluetongue virus from field populations of the obsoletus complexdn central Ttaly [Text] / G. Savini et al. // Vet. Ital. – 2004, 1 - 40 (3). - P. 369-373.
Meiswinkel, R. The 2006 outbreak of bluetongue in Northern Europe - the entomological perspective [Text] / R.Meiswinkel et al. // Prevent. Vet. Med. - 2008. - 87 (1-2).-P. 55-63.
Papadopoulos O., Mellor P.S., Mertens P.P. Mertens Papadopoulos, O. Bluetongue control strategies [Text] / O. Papadopoulos, P.S. Mellor, P.P. Mertens // Bluetongue / eds. P.S. Mellor, M. Baylis, P.P. Mertens. - Amsterdam; London. - 2008. - P. 429-452.
Verwoerd, D.W. Orbiviruses D.W. [Text] /Verwoerd, H. Huismans, B.J. Erasmus// Comprehensive Virology. - 1979. - 14. - P. 285-345.
Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals. [Text] /Chapter 2.1.3. Bluetongue. - OIE. - 2009.
Hofmann M.A. et al. Genetic Characterization of Toggenburg Orbivirus, a New Bluetongue Virus, from Goats, Switzerland [Text] / M.A. Hofmann et al. // Emerg. Inf. Dis. - 2008. - 14(12).-P. 1855-1861.
Mertens, P.P. Purification and properties of virus particles, infectious subviral particles, and cores of bluetongue virus serotypes 1 and 4 [Text] / P.P. Mertens, J.N. Burroughs, J. Anderson // Virology. - 1987. - 157. - P. 375-386.
Mertens, P.P. Analysis of the terminal sequences of the genome segments of four orbiviruses [Text] / P.P. Mertens, D.V. Sangar // Virology. - 1985. - 140. - P. 55-67.
Huismans, H. Identification of the serotype-specific and group-specific antigens of bluetongue virus [Text] / H. Huismans, B.J. Erasmus //Onderstepoort J. Vet. Res. -1981.-48.-P. 51-58.
Parsonson, I. Overview of bluetongue virus infection in sheep [Text] / I. Parsonson // Bluetongue, African Horse Sickness, and Related Orbiviruses. -1991. - P. 713-724.
Hassan, S.S. Expression and functional characterization of bluetongue virus VP2 protein: role in cell entry [Text] / Hassan S.S., Roy P. // J. Virol. - 1999. - 73. - P. 9832-9842.
Roy, P. Bluetongue virus proteins [Text] / P. Roy // J. Gen. Virol. - 1992. - 73. - P. 3051-3064.
Anthony S. et al. A duplex RT-PCR assay for detection of genome segment 7 (VP7 gene) from 24 BTV serotypes [Text] / S. Anthony et al. // J. Virol. Methods. - 2007. - 141. - P. 188-197.
Boyce M. et al. Purified recombinant bluetongue virus VP1 exhibits RNA replicase* activity [Text] / M. Boyce et al. // J. Virol. - 2004. - 78. - P . 3994-4002.
Huismans, H. Bluetongue virus structural components [Text] / H. Huismans, A.A. Van Dijk// Gurr. Top. Microbiol; Immunol. - 1990. - 162. - P. 21-41.
Stuart D.I. et al. Structural studies of orbivirus particles [Text] / D.I. Stuart et al. // Arch. Virol. Suppl. - 1998. - 14. - P. 235-250.
Nason E.L. et al. Interactions between the inner and outer capsids of bluetongue virus [Text] / E.L. Nason et al. //J. Virol. - 2004. - 78. - P. 8059-8067.
Sutton G. et al. Bluetongue virus VP4 is an RNA-capping assembly line [Text] / G. Sutton et al. //Nat. Struct. Mol. Biol. -2007. - 14. - P . 449-451.
Stauber N. et al. Bluetongue virus VP6 protein binds ATP and exhibits an RNA-dependent ATP ase function and a helicase activity that catalyze the unwinding of doublestranded RNA substrates [Text] / N. Stauber et al. // J.Virol.- 1997. -71. - P . 7220-7226.
Roy P. Bluetongue virus genetics and genome structure [Text] / Virus Research, 1989.- 13:179-206.
Mecham J.O. Detection and titration of bluetongue virus in Culicoides insect cell culture by an antigen-capture enzyme-linked immunosorbent assay [Text] / J. Virol Methods, 2006.-135: 269-271.
Anthony S., Jones H., Darpel K. E., et al. A duplex RT-PCR assay for detection of genome segment 7 (VP7 gene) from 24 BTV serotypes [Text] / J. Virol Methods, 2007.-141: 188-197.
Kato C.Y., Mayer R.T. An improved, highthroughput method for detection of bluetongue virus RNA in Cullicoides midges utilizing infrared-dye-labeled primers for reverse transcriptase PCR [Text] / J Virol Methods, 2007. 140: 140-147.
Miguel A.J., Montserrat A., Elena S.M., et al. High throughput detection of bluetongue virus by a new real-time fluorogenic reverse transcription-polmerase chain reaction: Application on clinical samples from current Mediterranean outbreaks [Text] / J. Vet. Diagn Invest, 2006.-18: 7-17.
Orru G., Ferrando M.L., Meloni M., et alRapid detection and quantitation of Bluetongue virus (BTV) using a Molecular Beacon fluorescent probe assay [Text] / J. Virol Methods, 2006.- 137: 34-42.
