СРАВНИТЕЛЬНАЯ ОЦЕНКА ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ОСЕТРОВЫХ РЫБ, ВЫРАЩИВАЕМЫХ В УСЛОВИЯХ АКВАКУЛЬТУРЫ
DOI:
https://doi.org/10.52578/2305-9397-2024-3-1-105-114Аннотация
В статье рассмотрены важные аспекты генетической структуры осетровых видов рыб, влияющие на адаптивный потенциал рыб при выращивании в условиях установок замкнутого водоснабжения (УЗВ). Осетровые рыбы, такие как Acipenser baerii, Acipenser gueldenstaedtii и Huso huso, представляют ценность для промышленного применения, но находятся под угрозой из-за сократившейся численности в естественной среде и риска инбридинга в условиях УЗВ.
Главной целью исследования является изучение генетической структуры осетровых, что может послужить основой для разработки стратегий по сохранению этих видов. Исследование генетической структуры осетровых видов рыб проведено с использованием микросателлитных молекулярных маркеров (STR). Анализ показал различия в генетическом разнообразии между выборками сибирского осетра, русского осетра и белуги. Обнаружен дефицит гетерозигот в искусственных выборках осетров, свидетельствующий о возможном инбридинге.
Генетический анализ также выявил некоторую генетическую дифференциацию между популяциями, что может быть обусловлено географической структурой или другими факторами.
Исследование позволяет рекомендовать увеличение генетического разнообразия путем введения особей из естественных условий в популяции осетров в аквакультуре. Регулярный мониторинг генетических параметров в аквакультурных популяциях и контроль динамики разнообразия также важны для сохранения и устойчивости популяций осетровых рыб.
Библиографические ссылки
Чебанов, М.С. Формирование генетической коллекции осетровых в южном филиале ФГУП ФСГЦР. Материалы Первой Всероссийской конференции «Генетика, селекция и воспроизводство рыб», СПб, Российская Федерация, 2002, – С. 73-80
Peng, Z. Age and biogeography of major clades in sturgeons and paddlefishes (Pisces: Acipenseriformes) // Mol. Phylogenetics Evol. 2007, – V. 42, – P. 854-862.
Fontana, F., Congiu L., Mudrak V.A., Quattro J.M., Smith T.I., Ware K., Doroshov S.I. Evidence of hexaploid karyotype in shortnose sturgeon // Genome. 2008, – V. 51, – P. 113-119.
Dufresne, F. Recent progress and challenges in population genetics of polyploid organisms: an overview of current state-of-the-art molecular and statistical tools// Mol. Ecol. 2014, – V. 23. –
P. 40-69.
Васильев, В.П. Эволюционная кариология рыб. Наука, Москва, Российская Федерация. 1985. – 300 c.
Семенова, А.В. Анализ микросателлитной ДНК у камчатской микижи (Parasalmo (Oncorhynchus) mykiss). Подбор локусов и оптимизация методики// Russ J Genet. 2010, – № 46 (6), – C. 1-4.
McQuown E.C. Microsatellite analysis of genetic variation in sturgeon: new primers sequences for Scaphirhynchus and Acipenser. Trans. Am. Fish. Soc. 2000, – V. 129, – P. 1380-1388.
Henderson-Arzapalo, A. Novel microsatellite markers for Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus) population delineation and broodstock management. Mol. Ecol. Notes. 2002, – V. 2. –
P. 437-439.
Welsh A.B., Blumberg, M., May B. Identification of microsatellite loci in lake sturgeon, Acipenser fulvescens, and their variability in green sturgeon, A. medirostris. Mol. Ecol. Notes. 2003. – P. 3. – P. 47-55.
May, B. Genetic variation at microsatellite loci in sturgeon: primer sequence homology in Acipenser and Scaphirhynchus // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1997, – V. 54, – P. 1542-1547.
Peakall, R. Genetic analysis in Excel, population genetic software for teaching and research. Mol. Ecol. Notes. 2006. – V. 6(1). – P. 288-295.
Nei, M. Genetic distance between populations // Amer. Naturalist. 1972, – V. 106. –
P. 283-292.
Pritchard, J.K., Stephens M., Donnelly, P. Inference of population structure using multilocus genotype data. // Genetics. 2000, – V. 155, – P. 945-959.
Jakobsson, M. A cluster matching and permutation program for dealing with label switching and multimodality in analysis of population structure. Bioinformatics. 2007, – V. 23(14), – P. 1801-1806.
Ludwig, A. Genome duplication events and functional reduction of ploidy levels in sturgeon (Acipenser, Huso and Scaphirhynchus)// Genetics. 2001. – V. 158(3). – P. 1203-1215.
Havelka, M. Molecular aspects of interspecific hybridization of sturgeons related to polyploidy and in situ conservation. Ph.D. thesis, USB, FFPW, RIFCH, Vodnany, 2013, – V. 102.
Georgescu, S. Analysis of the microsatellite variation in the common hybrid between Russian Sturgeon (Acipenser Gueldenstaedtii Brandt and Ratzeburg, 1833) and Siberian Sturgeon (Acipenser Baerii Brandt, 1869) from aquaculture// Transylv. Rev. Syst. Ecol. Res. 2013, – V. 15(2). – P. 117-124.
Peng, Z. Age and biogeography of major clades in sturgeons and paddlefishes (Pisces: Acipenseriformes)// Mol. Phylogenetics Evol. 2007. – V. 42. – V. 854-862.
Welsh, A. Development and standardization of disomic microsatellite loci for lake sturgeon genetic studies// J. Appl. Ichthyol., 2006. – V. 22. – V. 337-344.
Huson, D.H. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies. Mol. Biol. Evol. 2006. – V. 23(2). – P. 254-267.
REFERENCES
CHebanov, M.S. Formirovanie geneticheskoj kollekcii osetrovyh v yuzhnom filiale FGUP FSGCR. Materialy Pervoj Vserossijskoj konferencii «Genetika, selekciya i vosproizvodstvo ryb», SPb, Rossijskaya Federaciya, 2002, – S. 73-80
Peng, Z. Age and biogeography of major clades in sturgeons and paddlefishes (Pisces: Acipenseriformes) // Mol. Phylogenetics Evol. 2007, – V. 42, – P. 854-862.
Fontana, F., Congiu L., Mudrak V.A., Quattro J.M., Smith T.I., Ware K., Doroshov S.I. Evidence of hexaploid karyotype in shortnose sturgeon // Genome. 2008, – V. 51, – P. 113-119.
Dufresne, F. Recent progress and challenges in population genetics of polyploid organisms: an overview of current state-of-the-art molecular and statistical tools// Mol. Ecol. 2014, – V. 23. –
P. 40-69.
Vasil'ev, V.P. Evolyucionnaya kariologiya ryb. Nauka, Moskva, Rossijskaya Federaciya. 1985. – 300 c.
Semenova, A.V. Analiz mikrosatellitnoj DNK u kamchatskoj mikizhi (Parasalmo (Oncorhynchus) mykiss). Podbor lokusov i optimizaciya metodiki// Russ J Genet. 2010, – № 46 (6), – C. 1-4.
McQuown E.C. Microsatellite analysis of genetic variation in sturgeon: new primers sequences for Scaphirhynchus and Acipenser. Trans. Am. Fish. Soc. 2000, – V. 129, – P. 1380-1388.
Henderson-Arzapalo, A. Novel microsatellite markers for Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus) population delineation and broodstock management. Mol. Ecol. Notes. 2002, – V. 2. –
P. 437-439.
Welsh A.B., Blumberg, M., May B. Identification of microsatellite loci in lake sturgeon, Acipenser fulvescens, and their variability in green sturgeon, A. medirostris. Mol. Ecol. Notes. 2003. – P. 3. – P. 47-55.
May, B. Genetic variation at microsatellite loci in sturgeon: primer sequence homology in Acipenser and Scaphirhynchus // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1997, – V. 54, – P. 1542-1547.
Peakall, R. Genetic analysis in Excel, population genetic software for teaching and research. Mol. Ecol. Notes. 2006. – V. 6(1). – P. 288-295.
Nei, M. Genetic distance between populations // Amer. Naturalist. 1972, – V. 106. –
P. 283-292.
Pritchard, J.K., Stephens M., Donnelly, P. Inference of population structure using multilocus genotype data. // Genetics. 2000, – V. 155, – P. 945-959.
Jakobsson, M. A cluster matching and permutation program for dealing with label switching and multimodality in analysis of population structure. Bioinformatics. 2007, – V. 23(14), – P. 1801-1806.
Ludwig, A. Genome duplication events and functional reduction of ploidy levels in sturgeon (Acipenser, Huso and Scaphirhynchus)// Genetics. 2001. – V. 158(3). – P. 1203-1215.
Havelka, M. Molecular aspects of interspecific hybridization of sturgeons related to polyploidy and in situ conservation. Ph.D. thesis, USB, FFPW, RIFCH, Vodnany, 2013, – V. 102.
Georgescu, S. Analysis of the microsatellite variation in the common hybrid between Russian Sturgeon (Acipenser Gueldenstaedtii Brandt and Ratzeburg, 1833) and Siberian Sturgeon (Acipenser Baerii Brandt, 1869) from aquaculture// Transylv. Rev. Syst. Ecol. Res. 2013, – V. 15(2). – P. 117-124.
Peng, Z. Age and biogeography of major clades in sturgeons and paddlefishes (Pisces: Acipenseriformes)// Mol. Phylogenetics Evol. 2007. – V. 42. – V. 854-862.
Welsh, A. Development and standardization of disomic microsatellite loci for lake sturgeon genetic studies// J. Appl. Ichthyol., 2006. – V. 22. – V. 337-344.
Huson, D.H. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies. Mol. Biol. Evol. 2006. – V. 23(2). – P. 254-267.
