ВЫДЕЛЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА МУЛЬТИРЕЗИСТЕНТНЫХ ШТАММОВ ESCHERICHIA COLI У БРОЙЛЕРНЫХ КУР
DOI:
https://doi.org/10.52578/2305-9397-2025-4-1-93-102Ключевые слова:
Escherichia coli, бройлеры, суставы, кишечник, метагеномика, резистентность к антимикробным препаратамАннотация
- Нарушения опорно-двигательного аппарата у бройлерных кур являются актуальной проблемой птицеводства, приводящей к экономическим потерям и снижению благополучия птицы. В настоящем исследовании проведена характеристика бактериального состава кишечника и суставов цыплят-бройлеров с использованием методов метагеномного анализа и выделения бактериальных культур. Материалом для исследования послужили тушки кур с птицефабрики. Для определения микробного разнообразия использовали амплификацию и секвенирование участка гена 16S rRNA. В образцах суставных тканей и слепых отростков кишечника были определены бактерии семейства Enterobacteriaceae (89,85 и 0,76-5,79% соответственно). В дальнейшем проведена бактериологическая работа по выделению штаммов Escherichia coli. Из слепых отростков выделено три штамма, из суставных проб – два. Их идентификация выполнена с применением секвенирования по Сэнгеру и MALDI-TOF масс-спектрометрии. Тестирование антимикробной чувствительности методом диск-диффузии показало наличие сходных профилей мультирезистентности у всех изолятов. Все пять изолятов Escherichia coli из кишечника и суставов бройлеров продемонстрировали выраженную мультирезистентность, включая устойчивость к β-лактамам, аминогликозидам, фторхинолонам и ко-тримоксазолу при сохранении чувствительности лишь к нитрофурантоину, что указывает на возможное наличие у отдельных штаммов ESBL и их циркуляцию в хозяйстве. Данные исследования подчёркивают необходимость комплексного подхода в мониторинге и контроле антибиотикорезистентности в птицеводстве
Библиографические ссылки
Bradshaw R.H., Kirkden R.D., Broom D.M. A review of the aetiology and pathology of leg weakness in broilers in relation to welfare // Avian and Poultry Biology Reviews. – 2002. – Vol. 13. – P. 45–103. – doi:10.3184/147020602783698421.
Barnes H.J., Nolan L.K., Vaillancourt J.P. Colibacillosis. In: Saif Y.M., Fadly A.M., Glisson J.R., McDougald L.R., Nolan L.K., Swayne D.E. (eds). Diseases of Poultry. – Ames: Blackwell Publishing, 2008. – P. 691–732.
Riddell C. Leg problems still important // Poultry Digest. – 1997. – Vol. 56. – P. 28–31.
Assetova G.K., Bolkenov B.T. A comprehensive review of lameness in broilers: infectious and non-infectious factors in the context of Kazakhstan’s poultry industry // Herald of Science of S. Seifullin Kazakh Agro Technical Research University: Veterinary Sciences. – 2025. – № 2 (010). – P. 126–137.
Полуночкина Т.В., Дорофеева С.Г., Стаффорд В.В. Практический опыт антибиотикотерапии при патологии суставов у цыплят-бройлеров // Аграрная наука. – 2023. – № 2. – С. 39–46.
Lutful Kabir S.M. Avian colibacillosis and salmonellosis: a closer look at epidemiology, pathogenesis, diagnosis, control and public health concerns // International Journal of Environmental Research and Public Health. – 2010. – Vol. 7, № 1. – P. 89–114. – doi:10.3390/ijerph7010089.
Nolan L.K., Barnes H.J., Vaillancourt J.P., Abdul-Aziz T., Logue C.M. Colibacillosis. In: Swayne D.E. (ed.). Diseases of Poultry. – 13th ed. – Hoboken: Wiley-Blackwell, 2013. – P. 751–805.
Guabiraba R., Schouler C. Avian colibacillosis: still many black holes // FEMS Microbiology Letters. – 2015. – Vol. 362, № 15. – fnv118. – doi:10.1093/femsle/fnv118.
Mellata M. Human and avian extraintestinal pathogenic Escherichia coli: infections, zoonotic risks, and antibiotic resistance trends // Foodborne Pathogens and Disease. – 2013. – Vol. 10, № 11. – P. 916–932. – doi:10.1089/fpd.2013.1533.
Clermont O., Johnson J.R., Menard M., Denamur E. Determination of Escherichia coli phylogenetic group by PCR: application to the study of virulence in animal and human isolates // Journal of Clinical Microbiology. – 2000. – Vol. 38, № 4. – P. 1772–1775.
Ewers C., Antão E.M., Diehl I., Philipp H.C., Wieler L.H. Intestine and environment of the chicken as reservoirs for extraintestinal pathogenic Escherichia coli strains with zoonotic potential // Applied and Environmental Microbiology. – 2009. – Vol. 75, № 1. – P. 184–192. – doi:10.1128/AEM.01324-08.
Dziva F., Stevens M.P. Colibacillosis in poultry: unravelling the molecular basis of virulence of avian pathogenic Escherichia coli in their natural hosts // Avian Pathology. – 2008. – Vol. 37, № 4. – P. 355–366. – doi:10.1080/03079450802216652.
Kaper J.B., Nataro J.P., Mobley H.L.T. Pathogenic Escherichia coli // Nature Reviews Microbiology. – 2004. – Vol. 2, № 2. – P. 123–140. – doi:10.1038/nrmicro818.
Amplicon PCR, PCR Clean-Up, PCR Index. 16S Metagenomic Sequencing Library Preparation. – San Diego (CA, USA): Illumina, 2013. – 21 p.
Bolyen E., Rideout J.R., Dillon M.R., et al. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 // Nature Biotechnology. – 2019. – Vol. 37, № 8. – P. 852–857. – doi:10.1038/s41587-019-0209-9.
Callahan B.J., McMurdie P.J., Rosen M.J., et al. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data // Nature Methods. – 2016. – Vol. 13, № 7. – P. 581–583. – doi:10.1038/nmeth.3869.
Quast C., Pruesse E., Yilmaz P., et al. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools // Nucleic Acids Research. – 2013. – Vol. 41 (Database issue). – P. D590–D596. – doi:10.1093/nar/gks1219.
Wickham H. ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis. – New York: Springer-Verlag, 2016. – 260 p. – ISBN 978-3-319-24277-4.
The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Antimicrobial susceptibility testing. EUCAST disk diffusion method. – Version 13.0. – January 2025. – URL: https://www.eucast.org (дата обращения: 20.09.2025).
Braga J.F.V., Chanteloup N.K., Trotereau A., Baucheron S., Guabiraba R., Ecco R., Schouler C. Diversity of Escherichia coli strains involved in vertebral osteomyelitis and arthritis in broilers in Brazil // BMC Veterinary Research. – 2016. – Vol. 12. – Art. 140. – doi:10.1186/s12917-016-0762-0.
Islam M.S., Nath C., Hasib F.M.Y., Logno T.A., Uddin M.H., Hassan M.M., Chowdhury S. Detection and characterization of multidrug resistant Escherichia coli carrying virulence gene isolated from broilers in Bangladesh // Veterinary Medicine and Science. – 2023. – Vol. 9, № 1. – P. 410–420. – doi:10.1002/vms3.700.
Islam M.S., Hossain J., Sobur A., Punom S.A., Rahman A.M.M.T., Rahman M.T. A systematic review on the occurrence of antimicrobial-resistant Escherichia coli in poultry and poultry environments in Bangladesh between 2010 and 2021 // BioMed Research International. – 2023. – Art. 2425564. – doi:10.1155/2023/2425564.
Bhattarai S., Khanal P., Adhikari A., Bhattarai R., Rijal K.P., Ghimire S., et al. Antimicrobial resistance of avian pathogenic Escherichia coli isolated from broiler, layer, and breeder chickens // Veterinary World. – 2024. – Vol. 17. – P. 103–112. – doi:10.14202/vetworld.2024.103-112.
Hasan B., Sandegren L., Melhus Å., Drobni M., Hernandez J., Waldenström J., Alam M., Olsen B. Antimicrobial drug–resistant Escherichia coli in wild birds and free-range poultry, Bangladesh // Emerging Infectious Diseases. – 2012. – Vol. 18, № 12. – P. 2055–2058. – doi:10.3201/eid1812.120513.
Benameur Q., Gervasi T., Dahloum L., Rechidi-Sidhoum N., Boutaiba Benklaouz M., Yakubu A. Multidrug-resistant Escherichia coli isolated from cleaned and disinfected poultry houses prior to day-old chick placement // Journal of Environmental Quality. – 2023. – Vol. 52, № 2. – P. 296–302. – doi:10.1002/jeq2.20456.
Montoro-Dasi L., Villagra A., Sevilla-Navarro S., Pérez-Gracia M.T., Vega S., Marín C. Commensal Escherichia coli antimicrobial-resistance and multidrug-resistance dynamics during broiler growing period: commercial vs improved farm conditions // Animals. – 2021. – Vol. 11, № 4. – Art. 1005. – doi:10.3390/ani11041005.
Krivonogova A.S., Donnik I.M., Isaeva A.G., Loginov E.A., Petropavlovskiy M.V., Bespamyatnykh E.N. Antibiotic resistance of Enterobacteriaceae in microbiomes associated with poultry farming // Food Processing: Techniques and Technology. – 2023. – Vol. 53, № 4. – P. 556–569. – doi:10.21603/2074-9414-2023-4-2472.
